Den daglige udvikling og drift udføres af chefgruppen og fire forskellige afdelinger:
- Drift & Projekt, Renseanlæg
- Plan & Projekt, Afløbssystemer
- Drift & Projekt, Drikkevand
- Økonomi & Administration

Generalforsamling
Eftersom Skanderborg Forsyning A/S er ejet 100 procent af Skanderborg Kommune, er byrådet generalforsamling. Der bliver afholdt generalforsamling en gang om året.
Bestyrelse

Skanderborg Forsyning ledes gennem en bestyrelse på ni medlemmer. Generalforsamlingen har udpeget fire medlemmer, herunder formand og næstformand. Forbrugerne har valgt to medlemmer og medarbejderne har valgt tre repræsentanter. Bestyrelsen sidder frem til udgangen af 2025.
Bestyrelsesformand:
- Martin Frausing Poulsen (valgt af generalforsamlingen)
Næstformand:
- Tommas Leth (valgt af generalforsamlingen)
Øvrige bestyrelsesmedlemmer:
- Ole Drøgemüller (valgt af generalforsamlingen)
- Birte M. Andersen (valgt af generalforsamlingen)
- Benny Nielsen (forbrugervalgt)
- Palle Langkjær (forbrugervalgt)
- Stig Jonassen (medarbejdervalgt)
- Torsten Schriver Niewald (medarbejdervalgt)
- Birthe Dall (medarbejdervalgt)
Chefgruppe

Ledelsen sker gennem chefgruppen, der består af følgende medlemmer: